Пока что память гхол не научились разблокировать, может случайно пробудиться из за какого-то эмоционального события.
Ну и память 1 жизни особой роли не сыграет, нужно пробуждение памяти как у финального Дункана.
В данный момент любые умения контрит квисатц хадерах (которого судя по вступительному ролику не будет).

Глох тлейлаксу обучают базовым знаниям при помощи ГИПНОустройства по УЖЕ имеющихся гипнопрограмам всё остальные сведения предоставляет жакащик или по имеющихся у них данным. Глоха с памятью это их заветная мечта и кошмар для всех остальных. А Дункан был внезапным прарывом и то не с первого раза 

Я сейчас работаю с мозгом на современных технологиях. В общем чтобы получить что-то удобоваримое мы делаем десятки записей похожих событий и накладываем их друг на друга. Можно сделать также что навыки снимали с дестка однотипных действий. А вот что-то уникальное фиг вам.

Из памяти нельзя отличить правду от убеждений

Это очень сильное ограничение.

Человек искренне верит, что:

предатель — Питер; артефакт лежит в башне; пароль "12345".

Но он может ошибаться.

Ты извлекаешь именно его воспоминания, а не объективную истину.

Для разведки этого недостаточно. Соответственно ограничение информации, и создание ложных потоков. Как пример У Атрейдесов есть тайная база с ядерным арсеналом в щитовой стене, а на самом деле это десятая часть, а основной арсенал спрятан на Лунах. А в реальности в том арсенале ракеты пустышки, и только 3 боеготовых.

Как вариант 

Большая часть памяти не индексируется

Это похоже на человеческий мозг.

Если спросить:

какой номер машины стоял возле дома три года назад?

Он не вспомнит.

Но под гипнозом, возможно, да.

То есть память существует, но найти нужный кусок чрезвычайно сложно. Плюс добавить к этому, что Память защищается самой душой 

Без души память остается, но большая часть связей зашифрована.

Клон без души — просто контейнер. Гхола с другой душой может просто не мочь раскрыть память оригинала, ибо не подходят ключи,

Именно поэтому кхолы плохо подходят для добычи секретов.

идея "ментального шифрования"

Представь, что после открытия технологии чтения памяти прошло сто лет.Все государства начали обучать элиту специальной дисциплине.Что-то вроде:Окклюменции из Гарри Поттера,но научно-магической.Память перестраивается.
Любая попытка чтения получает бессмысленный поток образов.
Только владелец способен восстановить последовательность.

Требуется согласие мозга

Можно сделать интересное правило.

Если человек сопротивляется,

то память буквально разрушается.

Как современные SSD стирают ключ шифрования.

Поэтому допросы не работают.

Человек скорее уничтожит собственные воспоминания.

разделить декларативную и процедурную память. Декларативная — это факты ("пароль такой-то", "артефакт лежит там-то"), а процедурная — умения ("как варить мет", "как сваривать метал"). Именно процедурную память можно сравнительно безопасно копировать и использовать для создания учебных матриц. А вот декларативная память оказывается тесно переплетена с личностью, эмоциями и душой, поэтому ее извлечение ненадежно, фрагментарно и опасно. Такое разделение хорошо объясняет, почему Империя могла массово производить специалистов, но не могла просто «скачать» все секреты своих врагов.

Самой устойчивой выглядит комбинация:

память — это не готовая база данных, а огромный неструктурированный массив переживаний; для извлечения информации нужны сложные устройства и длительный анализ; душа выступает "ключом" ко многим ассоциативным связям; опыт, навыки и знания можно аккуратно упаковать в специальные обучающие матрицы, но только если они были подготовлены добровольно и профессионально; элита владеет техниками ментального шифрования и ложных воспоминаний. Тогда технология остается невероятно мощной — достаточно, чтобы существовали библиотеки памяти и учебные матрицы, — но не превращается в кнопку "узнать все секреты любого человека". Это сохраняет смысл разведки, шпионажа, контрразведки и политических интриг.

Автору.

Автор если решитесь на подобное то сделайте разбор памяти на составляющие, и проводите обучение пошагово, не как в фиках "миров Содружества" в виде рангов, а как сейчас, база "Математика", "Физика", ..., главное что бы кроме этих знаний был способ отработки и закрепления этих знаний на уровне рефлексов, и наработки понимания способов применения знаний в прикладной деятельности. Иначе будет сильное расхождение с истоком канона Дюна а это убивает всякий смысл. Ещё можно взять за основу подход ментатов и на этой базе организовать свой проект, также стоит внести корректировки разделив понятие о интеллекте, вроде эмоциональный, итд чтобы был предмет взаимодействия и возможности исправить проблему ментата в искажении проработав их, научившись переключаться.

Старый добрый регрес технологий, запреты и скорее всего память считает, что нужно помнить самые важные с эмоциональной точки зрения человека события.

а какя память у новорожденного? никакой. пробужденная память через пряность? запрет вроде есть и, вроде, обоснован. а если мало то вот вам пример пожилых которые под грузом памяти устали жить. им банально уже без разницы на почти всё. сюда до кучи можно вкинуть шизу от многих личностей и уже неиллюзорную опасность социуму. механизм влияния пряности не изучен и на выходе эта мерзость может вообще ничего не иметь психологически общего с человеком но иметь память многих людей. а теперь представим какой-нибудь разум паразита с телом человека, скажем осы наездницы. разум кальмара, акулы, кукушки.

Все очень просто.

Сестры Бене Гессерит и Бене Тлейлаксу.

Одни занимаются евгеникой и менталом, другие ДНК-инженеринг и программируют клетки.

Что не мешает в обоих случаях использовать сквозное шифрование для защиты от несанкционированного доступа.

Бене Гессерит пошли дальше. Они объединили методы. Потом. И стали клепать идеальные дубликаты.

Как это будет выглядеть? Для того чтобы получить доступ скажем Преподобной матерью, она должна дать определённую команду Голосом на определённой частоте.

Без этого, все что знает сестра будет хаотическим набором отрывков элементов, которые постоянно дробятся и соединяются в произвольном порядке.

А в случае Бене Тлейлаксу, то махай может через свою кровь и психофизическое программирование получать доступ к памяти нижестоящего. Схожий защитный механизм.

Как-то так

Касаемо баз знаний. То в условиях Дюны они де-факто несостоятельны в сравнении с мирами Содружества.

Невозможно без «изуверского ИИ» обработать эмпирический опыт и выдернуть из общей матрицы сознания.

Как и совместить с иными элементами для полноты знаний.

И ментаты не помогут. 

База знаний в Дюне — это скорее набор алгоритмов без принципов глубокого понимания.

ГГ благодаря спайсу получили «железо» иного качества.

Сейчас получат набор алгоритмов.

И все что им останется это получить эмпирический опыт.

Как? Виртуальный шлём и программированная среда ИИ.

Для скана памяти требуется добровольное согласие, что бы сканируемый искренне желал , и высокий интеллект и наче получается просто бессмысленная мешанина.

Во время батлерианского джихада много технологий были утрачены. Сразу после него возникла секта Серены Батлер, которая охватывала всю империю. Секта громила всю технику сложнее калькулятора (да и его тоже). По итогу и баз данных не осталось наверное.

Что то сохранили Бене Тлейлаксу. К ним никто не лез. Ибо опасно.

Подожди, но ведь сейчас(имею настоящее время истории Гхолы) еще нет даже намека на то, что гхола может пробудить память оригинала. Вроде бы ситуация с Дунканом - это стечение обстоятельств, которое открыло "ящик Пандоры". Так что, если такова нужда для сюжета, то можно, наверное, ввернуть такой момент, типа гг "вспомнил", при каких условиях у Дункана память прорезалась, поделился с ментатом и своими ИИ-шками и вуаля - магия свершилась. Но это будет не самый изящный ход.

Предлагаю для ведьм и клонов с пробуждённой памятью взять концепцию ноосферы . То есть пробуждённая память это виртуальное рабочее место развёрнутое на носителе , которое ни как не отражается на нейронно синоптических связях , а если их нет , то и нечего снимать .

У меня есть запоздалая идея как это все дело совместить:
1) Экспорт "навыка" - в процессе мы возбуждаем отдельные нейронные связи связанные исключительно с предметом \предметами, тем самым мы захватываем дополнительно и ассоциативные связи. После экспорта набор данных необходимо отчистить от "шума", тем самым их обезличить. Мы же не хотим что бы человек сходил с ума после импорта? (может вдохновить процесс загрузки из к.ф Превосходство 2014 г.)
2) Выгрузка всего - к сожалению мы получим только "снимок"(snapshot) текущего состояния Головного Мозга. Без конкретики и подсветки нейронных цепочек. Без этого нельзя сказать что именно находиться в этом массиве. Для разбора данного массива(даже стесняюсь назвать объем) потребуется как минимум узко специализированный ИИ и очень много времени. Это вы, как автор, уже показали на примере Годрика: он клепал клонов по шаблону и грузил данные через имплант, а не собирал им(клонам) Г.М. по нейронам - это "дорого".