В очередной раз насилуем ядро Paper 1.12.2 и выше.

Существует настройка в файле bukkit.yml по пути settings.world-container, по умолчанию её там нету, но вы можете указать, но из-за дебилизма разработчиков ядра она не работает (см. https://hub.spigotmc.org/jira/browse/SPIGOT-5824), но существуют аргументы запуска (флаги).

Флаг и все к нему алиасы: -W -world-dir -universe -world-container

Как юзать ето? Ответ прост: java -jar govno_a_ne_yadro.jar -W worlds

+++++++ВАЖНО++++++

К сожалению, если Вы удалите файл bukkit.yml и по умолчанию в нём (в ядре) добавить строчку settings.world-container, то она не применится.

Если Вы хотели бы создавать миры всегда в отдельной папке (прям при запуске сервера), то необходимо использовать флаги, но никак не конфигурацию. 😩

+++++++ВАЖНО+++++++

Так сложно? 😳