Черепашки-ниндзя на каждом шагу срывали планы Крэнга Прайма по терраформированию Земли в Измерение X. Что делать злому повелителю? Придумайте новую гнусную схему, чтобы создать армию Ультрамутантов! Крэанг повсюду похищали мутантов, в том числе черепах-ниндзя, ради их ДНК! Когда его братья вытащили через портал Kraang Dimension X, Леонардо должен нанять как союзников, так и врагов Черепашек-ниндзя, пока не стало слишком поздно.