Есть ряд проблем при создании виртмашин с несколькими дисками. Вагрант как-то криво это поддерживает. В данном способе создаются диски с помощью API витруалбокса, и потом уже эти диски подключаются к ВМ.

Файл example.sh - лишь для примера, то что в нём содержится к примеру создания нескольких дисков не относится. Самое интересное находится в Vagrantfile в разделах:

# create disks before "up" action

# create storage controller on first run

# attach storage devices 

# cleanup after "destroy" action

Не стесняйтесь читать комменты, я постарался описать все ключевые строки.